Badan Pendapatan dan Aset Daerah mempunyai tugas membantu Gubernur dalam melaksanakan fungsi penunjang urusan pemerintahan di bidang pendapatan dan aset daerah yang menjadi kewenangan daerah.
Merumuskan program kerja Badan Pendapatan dan Aset Daerah yang mencakup kesekretariatan, pajak dan retribusi daerah, pengelolaan kekayaan daerah yang dipisahkan, pendapatan asli daerah lainnya yang sah, dana perimbangan, analisa kebutuhan dan penatausahaan aset, serta pemanfaatan, pemindahtanganan, dan pengamanan aset.
UPTD BPAD tersebar di 22 kabupaten/kota di Provinsi Nusa Tenggara Timur dengan tugas melaksanakan pemungutan pajak daerah, mengelola administrasi perpajakan daerah, serta melakukan verifikasi dan penagihan pajak.
Struktur UPTD terdiri dari Kepala UPTD, Sub Bagian Tata Usaha, Seksi Penetapan dan Penagihan, serta Seksi Verifikasi.
| No | UPTD |
|---|---|
| 1 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kota Kupang |
| 2 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Kupang |
| 3 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Timor Tengah Selatan |
| 4 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Timor Tengah Utara |
| 5 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Belu |
| 6 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Rote Ndao |
| 7 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Flores Timur |
| 8 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Lembata |
| 9 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Sikka |
| 10 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Ende |
| 11 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Nagekeo |
| 12 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Ngada |
| 13 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Manggarai Timur |
| 14 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Manggarai Barat |
| 15 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Manggarai |
| 16 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Sumba Timur |
| 17 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Sumba Tengah |
| 18 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Sumba Barat |
| 19 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Sumba Barat Daya |
| 20 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Alor |
| 21 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Malaka |
| 22 | UPTD Pendapatan Daerah Wilayah Kab. Sabu Raijua |